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Espectrometria y R-project

Dudas y comentarios sobre la simulacion estadistca con R-Project

Espectrometria y R-project

Notapor charly » Vie, 11 May 2012, 17:42

ChemoSpec es una colección de funciones para el dibujo espectrogramas (como RMN y espectros IR) y llevando a cabo
diversas formas de arriba hacia abajo análisis exploratorio de datos, la incluyendo el análisis de agrupamiento jerárquico (HCA), análisis de componentes (PCA) y el agrupamiento basado en el modelo
(desde mclust). Clases S3 se utilizan y el los datos se almacenan en un objeto de Spectra creado durante datos
importar. Bidimensional y 3-dimensional se proporcionan métodos para la visualización, incluyendo
diagramas interactivos y MANOVA. Spec está diseñado para facilitar la comparación de las muestras de los grupos de tratamiento y de control, como suele encontrados en las investigaciones ecológicas o médica. es
diseñado para ser fácil de usar.

ChemoSpec: an R Package for the Chemometric Analysis of Spectroscopic Data








1 Introduction 2
2 A Sample Exploration 3
2.1 Getting Data into ChemoSpec . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3
2.2 Preliminary Inspection of Data . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5
2.2.1 Plotting the Spectra . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7
2.2.2 Identifying & Removing Problematic Samples . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 8
2.2.3 Identifying & Removing Regions of No Interest . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10
2.3 Data Pre-Processing Options . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12
2.4 Hierarchical Cluster Analysis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13
2.5 Principal Components Analysis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13
2.6 ANOVA-PCA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27
2.7 Model-Based Clustering Using mclust . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 29
3 Functions That Are Not Discussed But Probably Should Be! 30
4 Technical Background 34
5 Acknowledgements 34
6 The Competition 34
References 34
1 Introduction
Chemometrics, as de ned by Va
charly
 
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